办理大气污染防治乙级资质的流程大致可以分为以下几个步骤：

工商注册：

首先，确保你的企业已经完成了工商注册，具有独立法人资格，且经营范围覆盖环境工程设计或大气污染防治等相关内容。

组建专业团队：

根据资质要求，配置相应的专业技术人员，包括注册一级结构工程师、注册电气（供配电）工程师、注册机械工程师、注册公用设备（暖通空调）工程师、环保工程师等，同时确保有非注册环境专业人员及其他辅助人员。

购买软件：

购买并安装指定的资质申报软件，如北京建设信源资讯有限公司提供的相关软件，用于在线申报和资料管理。

人员注册与配置：

在相关行业协会或政府部门网站上注册上述专业人员，确保他们的资质能够被认可，并配置到相应的项目中。

准备上报资料：

根据资质申请要求，准备完整的申请材料，包括但不限于企业法人营业执照副本、企业章程、技术人员的资质证书、劳动合同、社保缴纳证明、企业财务审计报告、质量管理体系认证（如有）、已完成项目业绩证明材料等。

网上申报：

使用购买的软件进行网上申报，填写相关信息，上传所有准备好的电子版申请材料。

打印并形成上报材料：

完成网上申报后，根据系统提示打印出纸质材料，形成正式的上报文件。

递交材料：

将整理好的纸质材料递交给负责审批的部门，通常是市建委或省（自治区、直辖市）住房城乡建设厅（局）或生态环境厅（局），具体提交地点根据地方规定而定。

等待审批：

审批流程通常包括市建委初审、省建厅复审等环节。在此期间，可能需要根据审查反馈补充或修正材料。

现场核查：

部分地区或情况下，审批机关可能会安排现场核查，以验证企业实际运营情况、人员配置及项目业绩的真实性。

领取资质证书：

审批通过后，企业将被通知领取大气污染防治乙级资质证书。领取后，企业应确保资质的有效管理和维护，按期进行资质延续或升级申请。

请注意，具体流程和要求可能会随政策调整而变化，务必提前咨询当地相关部门，获取最新的申请指南。